Durante i dieci anni di occupazione sovietica, Hekmatyar guidò una della principali organizzazioni di mujaheddin da Peshawar, in Pakistan. La sua attività anti sovietica non sfuggì agli Usa, che via ISI gli fecero arrivare miliardi di dollari e di armamenti, compresi quegli Stinger che fino a qualche tempo fa venivano ancora utilizzati dai talebani. Dopo il crollo del regime filo sovietico di Najibullah nel 1992, Hekmatyar e le altre fazioni di mujaheddin fecero di Kabul il campo di battaglia per la loro lotta di potere.

La città venne distrutta e migliaia di persone morirono.

Nel giugno del 1996 Hekmatyar concluse un accordo con i nemici tagiki e si insediò come primo ministro a Kabul, dove governava il presidente Rabbani. Un po' troppo per questo mancato ingegnere dedito al terrorismo, e l'ISI spostò il sostegno da Hekmatyar ai Talebani del Mullah Omar. Il vecchio mujaheddin fu costretto all'esilio in Iran.

Oggi che è uno dei grandi nemici degli Usa nella lotta al terrorismo ripete la necessità di una guerra santa contro la Potenza che un tempo lo aiutò. Dopo il crollo del regime dei Talebani nel dicembre 2001, Hekmatyar ha guidato la ribellione nel Nord e nell'Est dell'Afghanistan.

A maggio dello scorso anno, si era apertamente schierato con al Qaida, facendo sapere che era pronto a combattere agli ordini di Osama bin Laden. Con il Mullah Omar, al Sud, e bin Laden all'Ovest, i tre formano il cosiddetto "Triangolo del Terrore". All'inizio del 2007 si è parlato di trattative in corso con il governo del presidente Hamid Karzai, ma Hekmatyar ha sempre smentito.

Hekmatyar ha due mogli, della sua stessa tribù, sei figlie e tre figli. Secondo fonti giornalistiche, una moglie vive in Iran e l'altra nel campo profughi di Shamshatoo a Peshawar. Parla dari (farsi), pashtu, inglese, urdu e arabo.